442 lines
18 KiB
C#

//using Adaptation.Shared;
//using Adaptation.Shared.Metrology;
//using log4net;
//using System;
//using System.Collections.Generic;
//using System.IO;
//using System.Linq;
//using System.Text;
//using System.Text.Json;
//using System.Text.RegularExpressions;
//namespace Adaptation.Helpers
//{
// public partial class ProcessData : IProcessData
// {
// public BioRadFile Header { get; private set; }
// public List<BioRadDetail> Details { get; private set; }
// private int _I;
// private readonly ILog _Log;
// private string _Data;
// public ProcessData(ILogic logic, ConfigData configData, List<FileInfo> fileInfoCollection, BioRadFile lastBioRadFile)
// {
// Header = null;
// fileInfoCollection.Clear();
// _I = 0; _Data = string.Empty;
// Details = new List<BioRadDetail>();
// _Log = LogManager.GetLogger(typeof(ProcessData));
// Tuple<BioRadFile, List<BioRadDetail>> tuple = Parse(logic, configData, fileInfoCollection, lastBioRadFile);
// Details.AddRange(tuple.Item2);
// Header = tuple.Item1;
// }
// public Tuple<string, JsonElement?, List<FileInfo>> GetResults(ILogic logic, ConfigDataBase configDataBase, List<FileInfo> fileInfoCollection)
// {
// Tuple<string, JsonElement?, List<FileInfo>> results;
// if (!(configDataBase is ConfigData configData))
// throw new Exception();
// List<Test> tests = new List<Test>();
// List<IProcessDataDescription> descriptions;
// EventName eventName = configData.GetEventNameValue();
// if (eventName == EventName.FileRead && Details.Any())
// {
// foreach (var item in Details)
// tests.Add(Test.BioRadQS408M);
// descriptions = configData.GetDescription(logic, tests, this);
// }
// else
// throw new Exception();
// if (!configData.EafHosted)
// {
// new FileRead.Description().GetDescription(logic, configData, tests, this);
// }
// if (tests.Count != descriptions.Count)
// throw new Exception();
// for (int i = 0; i < tests.Count; i++)
// {
// if (descriptions[i].Test != (int)tests[i])
// throw new Exception();
// }
// string json;
// if (descriptions[0] is Duplicator.Description)
// {
// List<Duplicator.Description> duplicatorDescriptions = (from l in descriptions select (Duplicator.Description)l).ToList();
// json = JsonSerializer.Serialize(duplicatorDescriptions, duplicatorDescriptions.GetType());
// }
// else if (descriptions[0] is FileRead.Description)
// {
// List<FileRead.Description> fileReadDescriptions = (from l in descriptions select (FileRead.Description)l).ToList();
// json = JsonSerializer.Serialize(fileReadDescriptions, fileReadDescriptions.GetType());
// }
// else
// throw new Exception();
// object @object = JsonSerializer.Deserialize<object>(json);
// if (!(@object is JsonElement jsonElement))
// throw new Exception();
// results = new Tuple<string, JsonElement?, List<FileInfo>>(logic.Logistics.Logistics1[0], jsonElement, fileInfoCollection);
// return results;
// }
// public static Dictionary<Test, List<Duplicator.Description>> GetKeyValuePairs(ConfigData configData, JsonElement jsonElement, List<Duplicator.Description> processDataDescriptions, bool extra = false)
// {
// Dictionary<Test, List<Duplicator.Description>> results = configData.GetKeyValuePairs(processDataDescriptions);
// configData.CheckProcessDataDescription(results, extra);
// return results;
// }
// public static List<FileRead.Description> GetProcessDataFileReadDescriptions(ConfigData configData, JsonElement jsonElement)
// {
// List<FileRead.Description> results = new List<FileRead.Description>();
// List<IProcessDataDescription> processDataDescriptions = configData.GetIProcessDataDescriptions(jsonElement);
// foreach (IProcessDataDescription processDataDescription in processDataDescriptions)
// {
// if (!(processDataDescription is FileRead.Description description))
// continue;
// results.Add(description);
// }
// return results;
// }
// public static string GetLines(ILogic logic, List<FileRead.Description> descriptions)
// {
// char del = '\t';
// StringBuilder results = new StringBuilder();
// FileRead.Description x = descriptions[0];
// results.Append(x.UniqueId).Append(del).
// Append(x.Date).Append(del).
// Append(x.Employee).Append(del).
// Append(x.Recipe).Append(del).
// Append(x.Reactor).Append(del).
// Append(x.RDS).Append(del).
// Append(x.PSN).Append(del).
// Append(x.Layer).Append(del).
// Append(x.Zone).Append(del).
// Append(x.Cassette).Append(del).
// Append(x.Wafer).Append(del).
// Append(x.RVThickness);
// return results.ToString();
// }
// internal static void PostOpenInsightMetrologyViewerAttachments(ILog log, ConfigData configData, Logistics logistics, DateTime dateTime, string logisticsSequenceMemoryDirectory, List<FileRead.Description> descriptions, string matchDirectory)
// {
// }
// private string GetBefore(string text)
// {
// string str;
// string str1;
// int num = _Data.IndexOf(text, _I);
// if (num <= -1)
// {
// str = _Data.Substring(_I);
// _I = _Data.Length;
// str1 = str.Trim();
// }
// else
// {
// str = _Data.Substring(_I, num - _I);
// _I = num + text.Length;
// str1 = str.Trim();
// }
// return str1;
// }
// private string GetBefore(string text, bool trim)
// {
// string str;
// string before;
// if (!trim)
// {
// int num = _Data.IndexOf(text, _I);
// if (num <= -1)
// {
// str = _Data.Substring(_I);
// _I = _Data.Length;
// before = str;
// }
// else
// {
// str = _Data.Substring(_I, num - _I);
// _I = num + text.Length;
// before = str;
// }
// }
// else
// {
// before = GetBefore(text);
// }
// return before;
// }
// private string GetToEOL()
// {
// return GetBefore("\n");
// }
// private string GetToEOL(bool trim)
// {
// string str;
// str = (!trim ? GetBefore("\n", false) : GetToEOL());
// return str;
// }
// private string GetToken()
// {
// while (true)
// {
// if ((_I >= _Data.Length ? true : !IsNullOrWhiteSpace(_Data.Substring(_I, 1))))
// {
// break;
// }
// _I++;
// }
// int num = _I;
// while (true)
// {
// if ((num >= _Data.Length ? true : IsNullOrWhiteSpace(_Data.Substring(num, 1))))
// {
// break;
// }
// num++;
// }
// string str = _Data.Substring(_I, num - _I);
// _I = num;
// return str.Trim();
// }
// private string GetToText(string text)
// {
// string str = _Data.Substring(_I, _Data.IndexOf(text, _I) - _I).Trim();
// return str;
// }
// private bool IsBlankLine()
// {
// int num = _Data.IndexOf("\n", _I);
// return IsNullOrWhiteSpace((num > -1 ? _Data.Substring(_I, num - _I) : _Data.Substring(_I)));
// }
// private bool IsNullOrWhiteSpace(string text)
// {
// bool flag;
// int num = 0;
// while (true)
// {
// if (num >= text.Length)
// {
// flag = true;
// break;
// }
// else if (char.IsWhiteSpace(text[num]))
// {
// num++;
// }
// else
// {
// flag = false;
// break;
// }
// }
// return flag;
// }
// private string PeekNextLine()
// {
// int num = _I;
// string toEOL = GetToEOL();
// _I = num;
// return toEOL;
// }
// private void ScanPast(string text)
// {
// int num = _Data.IndexOf(text, _I);
// if (num <= -1)
// {
// _I = _Data.Length;
// }
// else
// {
// _I = num + text.Length;
// }
// }
// private Tuple<BioRadFile, List<BioRadDetail>> Parse(ILogic logic, ConfigData configData, List<FileInfo> fileInfoCollection, BioRadFile lastBioRadFile)
// {
// Tuple<BioRadFile, List<BioRadDetail>> result;
// BioRadFile bioRadFile = new BioRadFile { JobID = logic.Logistics.JobID, MesEntity = logic.Logistics.MesEntity };
// _I = 0; _Data = string.Empty;
// string h = string.Empty;
// List<BioRadDetail> bioRadDetails = new List<BioRadDetail>();
// string receivedData = File.ReadAllText(logic.Logistics.ReportFullPath);
// _Log.Debug($"****ParseData - Source file contents:");
// _Log.Debug(receivedData);
// string[] files = Directory.GetFiles(Path.GetDirectoryName(logic.Logistics.ReportFullPath), string.Concat(configData.OriginalDataBioRad, logic.Logistics.Sequence, "*"), SearchOption.TopDirectoryOnly);
// foreach (string file in files)
// fileInfoCollection.Add(new FileInfo(file));
// // occasionally there are multiple blocks of results, get the last one as earlier ones may be aborted runs.
// int index = receivedData.LastIndexOf("Bio-Rad");
// if (index > -1)
// receivedData = receivedData.Substring(index);
// _Log.Debug($"****ParseData - Source file contents to be parsed:");
// _Log.Debug(receivedData);
// if (!string.IsNullOrEmpty(receivedData))
// {
// _I = 0; _Data = receivedData;
// bioRadFile.Title = GetBefore("Recipe:");
// bioRadFile.Recipe = GetToken();
// bioRadFile.Date = GetToEOL();
// ScanPast("operator:");
// bioRadFile.Employee = GetBefore("batch:");
// bioRadFile.Batch = GetToEOL();
// // Remove illegal characters \/:*?"<>| found in the Batch
// bioRadFile.Batch = Regex.Replace(bioRadFile.Batch, @"[\\,\/,\:,\*,\?,\"",\<,\>,\|]", "_").Split('\r')[0].Split('\n')[0];
// ScanPast("cassette:");
// bioRadFile.Cassette = GetBefore("wafer:");
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Batch))
// {
// _I = 0; _Data = receivedData;
// ScanPast("wafer:");
// }
// bioRadFile.Wafer = GetToEOL();
// GetToEOL();
// GetToEOL();
// string token = GetToken();
// int counter = 1;
// while (true)
// {
// if ((string.IsNullOrEmpty(token) ? true : !char.IsDigit(token[0])))
// break;
// BioRadDetail bioRadDetail = new BioRadDetail()
// {
// Position = token,
// Thickness = GetToken(),
// UniqueId = string.Concat("_Point-", counter)
// };
// bioRadDetails.Add(bioRadDetail);
// token = GetToken();
// counter++;
// }
// ScanPast("mean thickness =");
// bioRadFile.MeanThickness = GetBefore(", std. dev =");
// bioRadFile.StdDev = GetToken();
// bioRadFile.PassFail = GetToEOL();
// ScanPast("thickness");
// bioRadFile.RVThickness = GetToEOL();
// }
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Wafer))
// throw new Exception("Wafer field is missing.");
// //parse out batch and validate
// string[] parsedBatch = bioRadFile.Wafer.Split('-');
// if (parsedBatch.Length >= 1)
// bioRadFile.Reactor = parsedBatch[0];
// if (parsedBatch.Length >= 2)
// bioRadFile.RDS = parsedBatch[1];
// if (parsedBatch.Length >= 3)
// {
// string[] parsedPSN = parsedBatch[2].Split('.');
// if (parsedPSN.Length >= 1)
// bioRadFile.PSN = parsedPSN[0];
// if (parsedPSN.Length >= 2)
// bioRadFile.Layer = parsedPSN[1];
// }
// if (parsedBatch.Length >= 4)
// bioRadFile.Zone = parsedBatch[3];
// bioRadFile.JobID = logic.Logistics.JobID;
// if (logic.Logistics.DateTimeFromSequence > DateTime.Now.AddHours(-24))
// {
// if (string.IsNullOrEmpty(lastBioRadFile.Wafer))
// {
// lastBioRadFile.Batch = bioRadFile.JobID;
// lastBioRadFile.Cassette = bioRadFile.JobID;
// lastBioRadFile.Employee = bioRadFile.JobID;
// lastBioRadFile.Recipe = bioRadFile.JobID;
// lastBioRadFile.Title = bioRadFile.JobID;
// }
// lastBioRadFile.Wafer = bioRadFile.Wafer;
// lastBioRadFile.Reactor = bioRadFile.Reactor;
// lastBioRadFile.RDS = bioRadFile.RDS;
// string check = "--------";
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Batch) || bioRadFile.Batch.Contains(check))
// bioRadFile.Batch = lastBioRadFile.Batch;
// else
// lastBioRadFile.Batch = bioRadFile.Batch;
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Cassette) || bioRadFile.Cassette.Contains(check))
// bioRadFile.Cassette = lastBioRadFile.Cassette;
// else
// lastBioRadFile.Cassette = bioRadFile.Cassette;
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Employee) || bioRadFile.Employee.Contains(check))
// bioRadFile.Employee = lastBioRadFile.Employee;
// else
// lastBioRadFile.Employee = bioRadFile.Employee;
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Recipe) || bioRadFile.Recipe.Contains(check))
// bioRadFile.Recipe = lastBioRadFile.Recipe;
// else
// lastBioRadFile.Recipe = bioRadFile.Recipe;
// if (string.IsNullOrEmpty(bioRadFile.Title) || bioRadFile.Title.Contains(check))
// bioRadFile.Title = lastBioRadFile.Title;
// else
// lastBioRadFile.Title = bioRadFile.Title;
// }
// //fix title
// StringBuilder titleFixed = new StringBuilder();
// foreach (char c in bioRadFile.Title)
// {
// if (char.IsLetterOrDigit(c) || c == '-' || c == '.')
// titleFixed.Append(c);
// }
// bioRadFile.Title = titleFixed.ToString();
// //fix wafer
// StringBuilder waferFixed = new StringBuilder();
// foreach (char c in bioRadFile.Wafer)
// {
// if (char.IsLetterOrDigit(c) || c == '-' || c == '.')
// waferFixed.Append(c);
// }
// bioRadFile.Wafer = waferFixed.ToString();
// //overwrite incorrect datetime from tool
// bioRadFile.Date = DateTime.Now.ToString(); // defaults to format "G"
// //create filename / unique id
// bioRadFile.UniqueId = string.Concat(bioRadFile.Title, "_", bioRadFile.Wafer, "_", DateTime.Now.ToString("yyyyMMddHHmmssffff"));
// foreach (BioRadDetail detail in bioRadDetails)
// {
// detail.HeaderUniqueId = bioRadFile.UniqueId;
// detail.UniqueId = string.Concat(bioRadFile.UniqueId, detail.UniqueId);
// }
// //trace datatype
// _Log.Debug("BioRad parsed infomation:");
// _Log.Debug(string.Format("Batch: {0}", bioRadFile.Batch));
// _Log.Debug(string.Format("Cassette: {0}", bioRadFile.Cassette));
// _Log.Debug(string.Format("Date: {0}", bioRadFile.Date));
// foreach (BioRadDetail bioRadDetail in bioRadDetails)
// _Log.Debug(string.Format("Details: {0} - {1}", bioRadDetail.Position, bioRadDetail.Thickness));
// _Log.Debug(string.Format("Mean Thickness: {0}", bioRadFile.MeanThickness));
// _Log.Debug(string.Format("Operator: {0}", bioRadFile.Employee));
// _Log.Debug(string.Format("Pass/Fail: {0}", bioRadFile.PassFail));
// _Log.Debug(string.Format("Recipe: {0}", bioRadFile.Recipe));
// _Log.Debug(string.Format("RV Thickness: {0}", bioRadFile.RVThickness));
// _Log.Debug(string.Format("Std Dev: {0}", bioRadFile.StdDev));
// _Log.Debug(string.Format("Title: {0}", bioRadFile.Title));
// _Log.Debug(string.Format("Wafer: {0}", bioRadFile.Wafer));
// fileInfoCollection.Add(new FileInfo(logic.Logistics.ReportFullPath));
// result = new Tuple<BioRadFile, List<BioRadDetail>>(bioRadFile, bioRadDetails);
// return result;
// }
// }
//}